Dans les logs d'accès ssh (/var/log/auth.log), si vous avez passé le loglevel de SSH à VERBOSE, vous pouvez voir pour chaque accès la clé qui a été utilisé.
Le format est différent de celui dans authorized_keys pour des raisons de lisibilité j'imagine.. Pour faire la conversion depuis authorized_keys vers ce format :

echo key | base64 | md5
ou
ssh-keygen -lf key.pub